Frukto-oligosakkarider tilhører en gruppe forbindelser som er kollektivt kjent som prebiotics. Prebiotics blir ikke fordøyd av kroppen, men de anses å bedre helsen fordi det stimulerer veksten av gunstige tarmbakterier. Det finnes naturlig rikelig med bakterier i tarmene bestående av både “gode” helsefremmende bakterier, og den typen som kan forårsake infeksjoner og sykdom.
Noen prebiotics som blant annet FOS (frukto-oligosakkarider) fungerer som en katalysator for vekst av den “gode” typen bakterier (lactobacils and bifido bacteria). Ved å tilsette FOS til fôret stimuleres de “gode” bakteriene i tarmene og medvirker således til en sunn og god tarmflora.